STR变异类型的验证

作者：鉴定莫主任 发布时间：2016-07-05 00:00:00 人气：24

  2016-07-05  strby

    STRGA的验证:
    STRGA包括了Aw、A删和LOH三种变异类型，对此三种类型的变异采用单位点扩增后测序验证。
1．Identifiler系统15个STR基因座和AMEL基因座的单位点引物扩增16个基因座单位点扩增引物见表12-5，优化扩增条件见表12-6。以标准DNA9947A为模板，采用单位点引物和表12-6所示扩增体系进行扩增，其凝胶电泳图见图12-10。

2．采用标准品DNA(9947A)对所建立的单位点扩增系统的j序效果进行验证表12-7所示为标准品DNA (9947A)的Identifiler 15个STR基因座的基因型。选取部分位点(D8S1179、THOI及最为复杂的D21S11)以9947A为模板进行PCR扩增，产物纯化后克隆测序对所建立的体系进行验证，每一基因座测序克隆不少于5个。图12-11～图12-13为测序图谱，图谱示各STR基因座测序分型正确。

3．对STRGA的测序验证
    随机选取10例部分出现STRGA变异的肿瘤组织样本，采用所建立的单位点扩增体系扩增纯化后，进行克隆测序，以验证检出的STRG^变异的准确性。10例肿瘤组织样本的STRGA变异涵盖了A~y,、A-dd和LOH三种类型，经克隆测序证

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